本作由TAKARATOMY公司开发销售，是掌机“火影忍者RPG”系列的第三作,前两作《火影忍者RPG 被继承的火之意志》(GBA)和《火影忍者RPG2 千鸟 VS 螺旋丸》(NDS)分别有18万套和15万套的出货成绩。本作则是完全的原创剧情，并加入使用NDS机能的大量直感触摸操作，另外还对应Nintendo WiFi connection机能，玩家可以与其他玩家进行联机对战。
把远古怪物复活的神秘组织“无”将在本作中登场，玩家将在游戏中扮演一位“木叶忍者”，与鸣人一起并肩作战。游戏通关后还将有隐藏要素出现。